Magyar-horvát viszonylatban a kisebbségi vegyes bizottságot a Felek között nem az alapszerződés, hanem külön kisebbségvédelmi szerződés, az 1995. április 5-én Eszéken aláírt, a Magyar Köztársaság és a Horvát Köztársaság között a Magyar Köztársaságban élő horvát kisebbség és a Horvát Köztársaságban élő magyar kisebbség jogainak védelméről szóló Egyezmény hozta létre. Az Egyezmény 16. cikke alapján a Felek „külön kormányközi kisebbségi Vegyesbizottságot hoznak létre, amely figyelemmel kíséri jelen Egyezmény rendelkezéseinek megvalósítását. A bizottságba mindkét Fél Kormánya megfelelő számú tagot delegál. A bizottság kisebbségi tagjait a kisebbségek szervezeteinek javaslatára nevezik ki”. A dokumentum emellett azt is kimondja, hogy a bizottság évente legalább egyszer ülésezik, felváltva Magyarországon, illetve Horvátországban; feladatai pedig a két kisebbséggel kapcsolatos időszerű kérdések megvitatása, az Egyezményből eredő kötelezettségek megvalósításának értékelése, valamint ajánlások előkészítése és elfogadása a két ország kormányai számára az Egyezmény megvalósításával, módosításával kapcsolatban.

A Magyar-Horvát KVB létrehozása óta 15 alkalommal ülésezett, melyek keretében az összes jegyzőkönyv elfogadásra, aláírásra került.