A közgyûlés az elnökség és a választmány egyharmadát újította meg. Újabb négy évre Egyed Ákost választották az EME elnökének.

A szervezet új fõtitkára: Bitay Enikõ lett. A közgyûlés elfogadta az EME kutatóintézetének szervezeti szabályát.

Kolozsvári ülésén az MTA Magyar Tudományosság Külföldön Elnöki Bizottság 2006. március 8-án állásfoglalást fogadott el Babeº-Bolyai Tudományegyetemmel kapcsolatosan.